基因中心在漢遜酵母產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用研究取得新進展
近日,基因中心聯(lián)合南開大學生命科學學院高山副教授等學者在國際著名期刊《Frontiers in Microbiology》(IF=5.640)發(fā)表題為“Full-Length Genome of an Ogataea polymorpha?Strain CBS4732 ura3Δ Reveals Large Duplicated Segments in Subtelomeric Regionsteins”的文章(原文鏈接:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2022.855666/full?&utm_source=Email_to_authors_&utm_medium=Email&utm_content=T1_11.5e1_author&utm_campaign=Email_publication&field=&journalName=Frontiers_in_Microbiology&id=855666)。基因中心貝錦龍副研究員為論文的共同第一作者。
漢遜酵母(Ogataea polymorpha)是產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用最廣泛的生物反應(yīng)器之一。CBS4732、NCYC495與DL-1是三種應(yīng)用最普遍與研究最多的漢遜酵母菌株。基于CBS4732營養(yǎng)缺陷型菌株,南開大學汪和睦教授曾開發(fā)了第一個全國產(chǎn)化的乙肝疫苗。但長期以來,由于缺乏高質(zhì)量的全基因組數(shù)據(jù),學界對三者之間的進化關(guān)系存在很大爭議?;蛑行奈⑸镔Y源室副主任貝錦龍博士長期深耕于甲醇酵母產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用領(lǐng)域。近年來與南開大學合作,通過對營養(yǎng)缺陷型CBS4732 ura3Δ菌株的高通量深度測序,得到了含有準確端粒信息的完整全長基因組。鑒定發(fā)現(xiàn)CBS4732與NCYC495菌株同屬一個種,且系統(tǒng)發(fā)育非常接近;因此基于兩種菌株的基礎(chǔ)研究成果和已開發(fā)產(chǎn)品可以完全合并。這為進一步深化漢遜酵母產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用,提供了堅實的理論基礎(chǔ)。同時,也在國際上首次報道了酵母亞端粒區(qū)存在長度達2.7萬bp以上的接近100%同一度的重復(fù)大片段,以迄今最強有力的證據(jù)確認了亞端粒區(qū)的大片段擴增是酵母基因組擴張最主要原因這一長期以來有爭議的科學假說。