水稻所分子育種團(tuán)隊(duì)在泛基因組研究方面取得重大進(jìn)展
近期,水稻研究所開展的作物泛基因組研究成果在線發(fā)表在國(guó)際著名期刊《Plant Biotechnology Journal》(TOP 1區(qū),IF:8.15)上,水稻所趙均良副研究員為第一作者,西澳大學(xué)David Edwards教授、國(guó)際半干旱熱帶地區(qū)作物研究所Rajeev Varshney教授為共同通訊作者。這也是水稻所首次通過國(guó)際合作并以第一完成單位第一完成人發(fā)表的高水平論文。????
泛基因組是作物群體中基因的總和,是最新的基因組學(xué)概念,代替單一參考基因組應(yīng)用于功能基因組學(xué)研究。泛基因組研究是目前作物基因組學(xué)研究的前沿和熱點(diǎn)。????
本研究利用國(guó)際半干旱熱帶地區(qū)作物研究所收集到的全世界木豆資源為材料,運(yùn)用新一代測(cè)序技術(shù)和生物信息學(xué)技術(shù),構(gòu)建了全世界第一個(gè)木豆泛基因組,并以此為基礎(chǔ),對(duì)木豆的群體結(jié)構(gòu)、基因組進(jìn)化以及重要農(nóng)藝性狀功能基因進(jìn)行分析,目前鑒定到2000個(gè)在木豆參考基因組上不存在的全新的基因,找到3個(gè)與種子重量相關(guān)的功能基因。泛基因組為木豆后續(xù)功能基因組學(xué)研究和遺傳育種提供完整的基礎(chǔ)變異數(shù)據(jù)。????
該項(xiàng)研究為水稻等作物泛基因組組裝和研究提供了成熟可行的參考。