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動衛(wèi)所在豬德爾塔冠狀病毒遺傳演化方面取得新進展
近日，動衛(wèi)所聯(lián)合華南農(nóng)業(yè)大學(xué)等單位撰寫題為“Phylogeography and evolutionary dynamics analysis of porcine delta-coronavirus with host expansion to humans”的研究論文在獸醫(yī)權(quán)威期刊《Transboundary and Emerging Diseases》（Top一區(qū)期刊）在線發(fā)表（論文網(wǎng)址：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/tbed.14503）。華南農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院博士研究生李根、廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院動物衛(wèi)生研究所翟少倫研究員、我院擬進站博士后周霞博士為論文共同第一作者，華南農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院賀東生教授和陳瑞愛教授為共同通訊作者。
豬德爾塔冠狀病毒（PDCoV），又名豬丁型冠狀病毒，是具有包膜的單股正鏈RNA病毒，與新冠肺炎病毒（SARS-CoV-2）同屬于冠狀病毒科，是已知RNA病毒中基因組最大的一類病毒。PDCoV于2012年首次在香港豬群中被發(fā)現(xiàn)。2014年在美國各大豬場暴發(fā)該病，并隨后流行于世界各地，包括我國（圖1）。之后，多篇動物試驗研究證實PDCoV可感染雞、火雞、犢牛等，并表現(xiàn)出輕度腹瀉癥狀。2021年，Nature雜志還發(fā)表了PDCoV感染海地兒童的論文。在新冠肺炎大流行期間，人類高度關(guān)注包括PDCoV在內(nèi)的動物冠狀病毒跨物種傳播。
圖1 PDCoV在世界的流行分布
遺傳進化分析表明本研究分離的和已知的所有PDCoV毒株可分為中國譜系、美國譜系和東南亞等三大譜系（圖2）；重建的PDCoV全球空間擴散網(wǎng)絡(luò)研究顯示PDCoV起源于1996年左右的亞洲，2007年左右傳播到美國，然后蔓延到東亞和南美洲，海地人感染的PDCoV最有可能源自美國（圖3、圖4）。
圖2 PDCoV遺傳進化分析
圖3 PDCoV全基因組的歷史演化分析
圖4 PDCoV空間擴散
