基因中心聯(lián)合康奈爾大學綜述:植物蛋白質(zhì)組學與代謝組學技術(shù)方面的最新進展與展望
近日,基因中心多組學技術(shù)與基因挖掘研究團隊在國際學術(shù)期刊Molecular Horticulture發(fā)表題目為“Recent advances in proteomics and metabolomics in plants”的綜述論文(原文鏈接:https://molhort.biomedcentral.com/articles/10.1186/s43897-022-00038-9)?;蛑行年淌暄芯繂T為論文第一作者,我院特聘研究員康奈爾大學張勝研究員為通訊作者。
過去的十年中,系統(tǒng)生物學和多組學技術(shù)日益成為植物生物學研究的主流。質(zhì)譜和生物信息學工具,以及多組學數(shù)據(jù)整合分析算法的不斷發(fā)展,都大大助力了植物蛋白質(zhì)組學和代謝組學的最新進展。組學技術(shù)的進步推動了植物研究領(lǐng)域的快速發(fā)展,極大地促進了我們對植物自身代謝以及植物-環(huán)境互作機制等方面的理解。
該綜述回顧了基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學和代謝組學研究方法的最新進展,包括定量蛋白質(zhì)組學、蛋白質(zhì)翻譯后修飾、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)/配體相互作用、非靶向代謝組學、靶向代謝組學、空間分辨代謝組學、代謝流以及植物單細胞蛋白質(zhì)組學和單細胞代謝組學等。尤其是這些新興技術(shù)在植物生物學研究中的應(yīng)用,包括解析逆境脅迫應(yīng)答機理、基因/蛋白功能表征、代謝和信號通路探索以及天然產(chǎn)物發(fā)掘有關(guān)的實踐案例,并對基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學和代謝組學發(fā)展的未來前景進行了展望,特別是它們在系統(tǒng)生物學中的應(yīng)用和挑戰(zhàn)。
本研究得到廣東省重點領(lǐng)域研發(fā)計劃、廣東省科技計劃項目、廣東省農(nóng)業(yè)科學院協(xié)同創(chuàng)新中心項目、高水平農(nóng)業(yè)科學院科技創(chuàng)新戰(zhàn)略建設(shè)專項基金和美國農(nóng)業(yè)部項目等項目資助。