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動(dòng)衛(wèi)所在廣東省人工馴養(yǎng)竹鼠攜帶圓環(huán)病毒遺傳多樣性與跨種傳播研究方面取得新進(jìn)展
近日，動(dòng)衛(wèi)所在農(nóng)林科學(xué)期刊Transboundary and Emerging Diseases（獸醫(yī)學(xué)一區(qū)，IF=4.3）發(fā)表了題為“The Genetic Diversity and Interspecific Transmission of Circovirus in Rhizomys sinensisin Guangdong, Southern China”的研究性論文。研究團(tuán)隊(duì)在前期揭示了人工繁育竹鼠可攜帶多種嚙齒類冠狀病毒以及存在犬冠狀病毒的跨種間傳播（X.H. Wang. et al. Virus Evol. 2022）之后，該文進(jìn)一步揭示了其攜帶重組體圓環(huán)病毒的遺傳多樣性與跨種傳播事件，拓展了對(duì)竹鼠中圓環(huán)病毒的遺傳多樣性與跨種傳播的認(rèn)識(shí)。動(dòng)衛(wèi)所與華南農(nóng)業(yè)大學(xué)聯(lián)合培養(yǎng)的博士研究生任照文，袁子國(guó)教授、羅勝軍副研究員為論文共同第一作者，王曉虎研究員和廖明教授為論文共同通訊作者。
嚙齒動(dòng)物（嚙齒目，Rodentia）是全球分布最廣泛，種類最多的哺乳動(dòng)物，有33科2277種（約占所有哺乳動(dòng)物物種的43%）。竹鼠作為嚙齒動(dòng)物的一種，主要分布于中國(guó)南方，以竹子、芒草和植物莖稈等為食。該研究團(tuán)隊(duì)利用病毒宏轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、全基因組測(cè)序和生物信息學(xué)分析等方法展示了廣東省人工馴養(yǎng)竹鼠體內(nèi)的病毒組結(jié)構(gòu)特征。研究結(jié)果顯示，廣東省竹鼠種群攜帶的病毒reads覆蓋了22個(gè)病毒科，包含了大量的DNA病毒，其中圓環(huán)病毒科成員占據(jù)主導(dǎo)地位，其reads總數(shù)超過(guò)總病毒reads的75%。利用全基因組測(cè)序和生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)，廣東省的竹鼠體內(nèi)攜帶了3種圓環(huán)病毒，其中竹鼠圓環(huán)病毒（Bamboo rat circovirus）流行率最高，達(dá)64.1%（125/195）。目前，竹鼠圓環(huán)病毒分為3個(gè)進(jìn)化支，不同的進(jìn)化支在特定位點(diǎn)存在核苷酸替換規(guī)律，這很可能是該病毒進(jìn)化分群的關(guān)鍵。同時(shí)，研究團(tuán)隊(duì)首次從竹鼠種群中分離到豬圓環(huán)病毒2（PCV2），屬于PCV2d。這一發(fā)現(xiàn)將有助于進(jìn)一步理解PCV2的宿主范圍、遺傳進(jìn)化和流行病學(xué)，也為PCV2可通過(guò)嚙齒動(dòng)物傳播提供直接數(shù)據(jù)。此外，文章還監(jiān)測(cè)到竹鼠體內(nèi)可能存在一種新的圓環(huán)病毒，且種群的流行率較高（44.1%），與駱駝、蝙蝠和鯨魚來(lái)源的圓環(huán)病毒具有較近的親緣關(guān)系。
本研究得到了廣東省林業(yè)廳自然資源事務(wù)（生態(tài)林業(yè)建設(shè)）專項(xiàng)資金項(xiàng)目、廣東省科技規(guī)劃基金（2021B1212050021）、廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院協(xié)同創(chuàng)新中心項(xiàng)目（XTXM202202）、廣州市科技計(jì)劃項(xiàng)目（2023E04J1256）等資助。
原文鏈接：https://doi.org/10.1155/2023/6668569
