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動(dòng)衛(wèi)所在豬A群輪狀病毒遺傳多樣性研究方面取得新進(jìn)展
近日，動(dòng)衛(wèi)所在國(guó)際期刊Animals（中科院大類二區(qū)）發(fā)表了題為“Emergence of a Novel G4P[6] Porcine Rotavirus with Unique Sequence Duplication in NSP5 Gene in China”的研究性論文，揭示了豬A群輪狀病毒（porcine Rotavirus A，PoRVA）的遺傳多樣性與潛在的豬與人RVA基因重配現(xiàn)象，拓展了對(duì)RVA基因組學(xué)的認(rèn)識(shí)。動(dòng)衛(wèi)所豬病研究室周霞博士為論文第一作者，動(dòng)衛(wèi)所豬病研究室翟少倫研究員和新疆畜牧科學(xué)院獸醫(yī)研究所魏玉榮研究員為論文共同通訊作者。
輪狀病毒（Rotavirus，RV）是一種引起幼齡動(dòng)物和嬰幼兒急性腸胃炎的人獸共患病病原體，特別是在發(fā)展中國(guó)家，每年可造成約45萬(wàn)名5歲以下兒童死亡。豬輪狀病毒（Porcine rotavirus，PoRV）是引起仔豬病毒性腹瀉的主要病原體之一，仔豬感染PoRV后迅速發(fā)生腹瀉，嚴(yán)重者常常因脫水而死亡。RV由11個(gè)分段的RNA片段構(gòu)成，分別編碼6個(gè)結(jié)構(gòu)蛋白（VP1、VP2、VP3、VP4、VP6、VP7）和5或6個(gè)非結(jié)構(gòu)蛋白（NSP1、NSP2、NSP3、NSP4、NSP5/6）。其中，大多數(shù)NSP5基因片段的長(zhǎng)度約為667 bp，大于667 bp的NSP5基因片段非常罕見，特別是在中國(guó)，到目前為止，國(guó)內(nèi)僅報(bào)道了一株兔RV G3P[14]毒株（N5），其NSP5基因片段含有946個(gè)核苷酸。
該研究團(tuán)隊(duì)利用病毒全基因組測(cè)序和生物信息學(xué)方法，在廣東省的一頭患腹瀉仔豬中鑒定出1株具有較長(zhǎng)NSP5基因的PoRVA獨(dú)特毒株，命名為RVA/Pig-tc/CHN/S2CF/2023/G4P[6]，完整基因型為G4-P[6]-I1-R1-C1-M1-A8-N1-T1-E1-H1，該毒株在NSP5基因的3’末端非編碼區(qū)存在一段含有344個(gè)核苷酸的重復(fù)序列。同時(shí)，還發(fā)現(xiàn)該毒株的11個(gè)基因片段中有4個(gè)（VP4、VP6、VP2和NSP5）基因片段的核苷酸相似性與人源輪狀病毒最高，表明豬與人輪狀病毒之間存在潛在的種間傳播。RV基因序列分節(jié)段的特性是導(dǎo)致新毒株出現(xiàn)和種間傳播的重要原因，因此，文章再次提出了對(duì)RV的11個(gè)片段進(jìn)行基因組分析的必要性，以便為RV的種間傳播和溯源提供重要的理論基礎(chǔ)。
S2CF毒株NSP5基因重復(fù)序列插入位點(diǎn)示意圖
本研究得到了廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院“金穎之光”項(xiàng)目、新疆動(dòng)物疫病研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室項(xiàng)目、廣州市重點(diǎn)研發(fā)項(xiàng)目、廣東省畜禽疫病防治研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室項(xiàng)目和廣東省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳項(xiàng)目等資助。
