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動衛(wèi)所在豬新發(fā)病原——蓋塔病毒鑒定研究方面取得新進展
近日，動衛(wèi)所科研人員在國際期刊Microbiology Spectrum（中科院大類二區(qū)）發(fā)表題為“Emergence of a novel GIII Getah virus variant in pigs in Guangdong, China, 2023”的研究性論文，該研究從廣東省某發(fā)病豬場分離鑒定了一株蓋塔病毒，并進行全基因組測序和生物信息學(xué)分析，發(fā)現(xiàn)該病毒株屬于GⅢ基因型。動衛(wèi)所豬病研究室楚品品、復(fù)旦大學(xué)郭宏元、動衛(wèi)所豬病研究室周霞等為論文共同第一作者，動衛(wèi)所豬病研究室翟少倫研究員和復(fù)旦大學(xué)張榮教授為論文共同通訊作者。
發(fā)病豬臨床表現(xiàn)和蓋塔病毒GDHYLC23毒株分離鑒定
蓋塔病毒（Getah virus，GETV）隸屬于披膜病毒科（Togaviridae）甲病毒屬（Alphavirus），是一種由蚊蟲傳播的蟲媒病毒，可在蚊子體內(nèi)增殖并通過叮咬傳播給宿主動物，感染了GETV的宿主動物又成為傳染源被未感染蚊子叮咬，又傳回蚊子，形成“蚊子-宿主動物-蚊子”的循環(huán)模式。蓋塔病毒宿主范圍廣泛，目前發(fā)現(xiàn)的潛在感染宿主動物高達19種，甚至在人類中也檢測到GETV中和抗體的存在。蓋塔病毒感染宿主豬后，主要臨床表現(xiàn)為發(fā)熱、腹瀉和繁殖障礙，嚴重時甚至引起患病仔豬死亡。近年來蓋塔病毒引起豬病相關(guān)報道持續(xù)增加，給養(yǎng)豬業(yè)造成巨大的損失。
蓋塔病毒屬于RNA病毒，其核酸為單股正鏈RNA，基因組由5′非編碼區(qū)、兩個開放閱讀框（Open Reading Frame, ORF，ORF1和ORF2，分別編碼非結(jié)構(gòu)蛋白和結(jié)構(gòu)蛋白）和3′非編碼區(qū)組成，其中3′非編碼區(qū)極少出現(xiàn)連續(xù)堿基的缺失或插入。本研究從發(fā)生母豬流產(chǎn)，發(fā)情異常，腹瀉，新生仔豬體溫過低、水腫、共濟失調(diào)和死亡的豬場分離到一株豬蓋塔病毒，命名為GDHYLC23，并利用病毒全基因組測序和生物信息學(xué)方法，獲得病毒全基因組并對其進行分析，結(jié)果顯示該病毒株屬于GⅢ基因型，序列比對分析發(fā)現(xiàn)在其緊臨ORF1的3′非編碼區(qū)處存在一段較長插入，長度為32bp，該片段插入目前尚未見報道。該毒株的發(fā)現(xiàn)拓展了對豬蓋塔病毒多樣性以及變異性的認知，為引起相關(guān)豬病的研究奠定了基礎(chǔ)。
GDHYLC23毒株3′非編碼區(qū)序列比對分析和基因組遺傳進化樹
本研究得到國家自然科學(xué)基金項目、廣東省重點領(lǐng)域研發(fā)計劃、廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院項目、上海市重大科技專項項目、上海市優(yōu)秀學(xué)術(shù)帶頭人計劃和廣東省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳項目等資助。
