劉琦
研究員，水稻生物信息與大數(shù)據(jù)育種研究室主任，博士畢業(yè)于中國林業(yè)科學研究院林木遺傳育種專業(yè)，隨后在哈佛大學醫(yī)學院從事博士后研究工作，主要研究領域是生物信息學、比較基因組學與系統(tǒng)生物學，進一步應用于水稻育種研究。
已發(fā)表SCI論文36篇，其中作為一作（含共一和通訊）在Molecular Cell、Nucleic Acids Research、Briefings in Bioinformatics、EMBO reports、Bioinformatics、PLoS Computational Biology、Human mutation和Genomics等期刊上發(fā)表多篇高水平論文，作為主要生物信息學作者在Nature、Nature Protocols、Nature Communications、Cell Research等上發(fā)表基因轉錄后調控研究相關論文。
主持和參與多項課題，兩次獲得中國林學會“青年優(yōu)秀論文獎”。建立了多種生物信息學算法、軟件和數(shù)據(jù)庫，為基因調控研究提供重要的生物信息學支持。同時，基于RNA調控組學開展了RNA表觀修飾特別是tRNA修飾的生物學機制研究，開發(fā)TRAC-Seq計算方法首次實現(xiàn)單堿基分辨率的 m7G tRNA 修飾譜繪制，揭示了m7G修飾能影響特定基因的翻譯進而調節(jié)細胞分化，為開發(fā)tRNA水平的分子標記提供了新思路。目前開展的研究主要為運用上述軟件并開發(fā)新的生物信息學軟件和技術在個體和群體水平研究水稻生長發(fā)育、雜種優(yōu)勢、抗逆的系統(tǒng)調控機制，挖掘水稻優(yōu)勢性狀的分子標記，為基于大數(shù)據(jù)的精準育種提供重要理論基礎和生物信息學支持。
